いまや完全に主流を外れてしまった感じのMT車だが、スポーティ走行を楽しむ人には根強い人気がある。メカニカルな部分がほとんどなので、電子制御が行なわれているパーツのように、調子が悪くなったりよくなったりを繰り返すような分かりにくい異常は起こりにくい。

　ただし、トランスミッションやクラッチに異常が発生した場合には突然、走行不能となることも多いので、つねに注意すべきだ。ほとんどの場合、操作具合や走行状況に前兆が現れてくるので、わずかでも異常を感じたら、プロに点検整備を依頼したほうがよい。

　クラッチは、ブレーキパッドと同じように、使えば使うほど摩擦材が摩耗して、最終的には使用限界となる。使用限界が近づいたクラッチでは、摩擦材が充分に機能しないため、クラッチにスリップが発生する。これにより、発進加速が悪くなったり、登り坂での加速が悪くなったりする。こうしたクラッチの滑りが発生したら、早急にクラッチディスクを交換すべきだ。 　

　トランスミッション側で発生する異常は少ないが、もっともトラブルが起こりやすいのがシンクロナイザー。シンクロナイザーに異常が発生すると、1速とバックにシフトしにくくなることが多い。特定のギアだけ入りにくかったり、入れたつもりなのに勝手に抜けてしまうようになったら、プロに点検整備を依頼したほうがよい。

　操作時に異音が出たり、シフトレバーが大きく振動したりする場合も、点検整備が必要だ。

マニュアルトランスミッションで使用されているトランスミッションオイルは、ギアオイルと呼ばれることも多く、基本的な機能は潤滑のみ。FF車の場合はディファレンシャルギアも内蔵されているので、FR車より負担が大きいが、AT車のATFほどこまめに点検を行なう必要はない。

　オイル量の点検方法は、注入口のフィラープラグを開けて行なうが、オイル漏れが発見されないようならば、オイル量の点検を省略してもよい。実際、オイル量の点検はめんどうな作業であるうえ、オイルを見てもアマチュアが状態を判断することが難しい。だが、ギアオイルを定期的に交換していれば問題が起こることはない。
特に、フロントデフがLSDの場合は、ギアオイルの負担が大きいので、交換時期を守って早め早めに交換を行ないたいものだ。